中小企业是厦门经济的中坚力量，吸纳厦门市75%的就业人口，其创造的产值占全市生产总值的56%，外贸出口占比35%，缴纳的各种税收占比46%。因此，柯茂莲认为，“在当今全球经济酝酿深刻转型的关键时期，加强对中小企业的扶持尤为重要。”

2014年6月12日，台湾“行政院会”通过《中小企业发展条例》第36条之2修正草案，简称“你加薪、我减税”条款，即：当经济不景气时，中小企业老板在法定基本工资调整之外，为员工另外加薪，这部分可以在申报企业所得税时，以130%的比例抵扣，也就是加薪100元，可扣抵130元。

柯茂莲建议，厦门市可借鉴台湾经验，出台《厦门中小企业促进办法实施细则》，明确在2015-2019年，厦门中小企业以当年社会平均工资为基数，调高经理级以下员工薪资，就可享受在当年度企业所得额多扣抵5成的优惠，但抵税部分，须是扣除基数后的调整金额;积极与厦门地方税务部门沟通，依托厦门中小企业服务中心的平台作用，完善中小微企业公共服务平台功能，提高信息化服务水平，向厦门中小企业提供更加优质服务。